Het Bunkermuseum Schlei op Schiermonnikoog is gevestigd in een bunker die in de Tweede Wereldoorlog door het Duitse leger werd gebruikt. Het museum biedt informatie over de Tweede Wereldoorlog op Schiermonnikoog.

Tijdens de Tweede Wereldoorlog waren er net zoveel Duitse soldaten op Schiermonnikoog als oorspronkelijke bewoners, namelijk 600. Als onderdeel van de Atlantikwall bouwden deze soldaten een dorp van bunkers om zich te beschermen tegen de geallieerden. De codenaam voor dit dorp was Schlei, de Duitse naam voor de vissoort zeelt. Naast bunkers bestond het dorp uit radarinstallaties, luchtafweergeschut en gecamoufleerde barakken. 200 bouwvakkers van het vasteland hielpen bij de bouw van dit complex. Een van de bunkers die gebouwd werd was van het type Seeburg. Deze bunker was een centrale post en werd gebruikt als communicatiecentrum. Hier werden radiosignalen opgevangen om onder andere geallieerde bommenwerpers te kunnen onderscheppen. Het is in deze bunker dat het Bunkermuseum Schlei is gevestigd.

Bunkermuseum Schlei wordt beheerd door Stichting Bunkermuseum Schlei. Deze stichting heeft tot doel het verzamelen, bewaren en tentoonstellen van goederen en kennis over de Tweede Wereldoorlog. Ook verzorgt de stichting rondleidingen en lezingen. Om de paar jaar heeft het museum een nieuwe tentoonstelling over een specifiek onderwerp met betrekking tot de Tweede Wereldoorlog op en rond Schiermonnikoog. Voorbeelden hiervan zijn het smalspoor dat op Schiermonnikoog lag tijdens de Tweede Wereldoorlog en een tentoonstelling in het kader van 75 jaar bevrijding.